MicroRNA (miRNA)是一类较小的内源性RNA,长度约为21-25个核苷酸。它们通过与目标mRNA结合,进而抑制转录后的基因表达,在动植物中发挥重要的调节作用。近期的报道揭示了动植物中miRNA的合成途径和调控机制;基于其与疾病的特定关系,已经针对miRNA开展了一些临床前和临床中的探究性研究。这些关于miRNA的研究将有助于蛋白质功能的破译,加速新药的发现过程。
安必奇生物拥有转录组研究平台及该领域的研究团队,可以帮助用户深入了解miRNA的合成、基因组调控机制以及其在生物体内的广泛作用。我们关注miRNA的前沿研究进展,提供各种miRNA的产品,如模拟物agomirs,抑制剂antagomirs等,促进miRNA治疗的研究进展。值得注意的是,我们已经开发了一系列microRNA agomir/ antagomir设计定制服务,通过预测和分析RNA的不同结构,帮助客户合成满足特定需求的高品质miRNA。
Antagomir (anti-miRNA, blockmir)是一类具有化学修饰的合成RNA片段,包括5'末端(硫代磷酸酯),3'端胆固醇,3'末端(硫代磷酸酯),和全链的2'-甲氧基修饰。这种小的单链合成RNA技术,在2005年初次被描述,是沉默内源性miRNA的一种新方法。Antagomir的序列与其自身成熟的miRNA完全互补,通过导致miRNA降解来发挥沉默作用。研究显示,这种沉默作用不仅特异性高,而且是长期作用的。Antagomir和inhibitor均可用于抑制miRNA的功能性研究,二者的区别主要体现在修饰方式上;而在动物实验中,使用antagomir具有更多的优势。
Agomir是一类小的双链合成RNA片段,在反义链上具有相同的化学修饰,包括3'端胆固醇,5'端两个硫代骨架,3'端四个硫代骨架,和整个序列的2'-甲氧基修饰。Agomir可以通过模仿内源性miRNA来达到上调其活性的目的。作为miRNA的模拟物,Agomir通过miRNA成熟的细胞内机制可以被鉴定;它们通过直接与靶标结合来发挥作用。影响agomir/ antagomir和mRNA相互作用的因素很多,设计优化后的miRNA可以作为转录后机制探究的有力工具。
MicroRNA是天然存在的小型非蛋白质编码序列,参与转录后基因调控,并与多种生物学过程和疾病相关。这些小RNA在许多复杂的病理及生理反应中发挥巨大的作用,使其成为哺乳动物和植物系统研究中的关键靶标。Antagomir可以抑制mRNA的结合位点,使内源性miRNA特异性沉默;agomir可以使内源性miRNA表达上调,并且能够长期作用。因此,在miRNA的研究中,越来越多的科研人员关注这些合成的miRNA序列。
我们知道,影响agomir/ antagomir和mRNA相互结合并发生作用的因素很多,包括特异性、强度、稳定性等等。合理的寡核苷酸设计可为合成理想的agomir/ antagomir打下基础,降低验证实验中miRNA脱靶或失效的风险。在安必奇生物,我们的技术团队为miRNA的结构分析和前期设计提供了各种有利的策略,包括但不限于以下几种:
安必奇生物开发了针对RNA二级结构的预测分析服务。RNA二级结构的准确预测,对指导agomir/ antagomir的设计、提高其效用,带来了巨大帮助。目前已经有一些计算方法用来预测单个mRNA的结构和折叠模式,诸如mfold、sfold程序等等。
安必奇生物可以为RNA二级结构提供准确的鉴定服务。通过对mRNA局部可杂交的区域的分析,如联合序列、内循环、10个或10个以上连续核苷酸的发夹结构,我们可以设计出靶向性更高的agomir/ antagomir结构。因为高度保守的基序是agomir/ antagomir的良好靶标,预测RNA二级局部结构中的高度保守的基序并把它们作为靶标,是提高agomir/ antagomir命中率的有力方式。
安必奇生物可以提供miRNA基序搜索及GC含量计算的技术服务。在agomir/ antagomir的作用中,RNase的活性可能与GC 含量有较强的相关性,并且,GC含量也会对热力学稳定性产生影响。选择合适的GC 含量,能够提高agomir/ antagomir的作用效果。
考虑到热力学能对agomir/ antagomir的影响,安必奇生物引入了结合能预测分析来改进agomir/ antagomir的设计。当agomir/ antagomir与mRNA之间的结合形成适宜结构时,相应设计得到的agomir/ antagomir就能发挥出更加理想的靶向性及治疗效果。
与正常的miRNA抑制剂和模拟物相比,agomir/ antagomir是长期miRNA功能获得和功能丧失研究的良好候选对象。安必奇生物先进的检测平台和丰富的小分子设计经验,能够满足客户对不同类型miRNA的需求。我们的agomir/ antagomir设计策略,包含从预测-分析-设计-验证在内的一站式定制方案,以及完善的售前、售后服务。
如果您对microRNA agomir/ antagomir的相关服务感兴趣,请随时与我们联系,我们的技术人员会在24小时内回复您的问题并提供相应的报价。
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