在生命科学领域中无论是设计引物还是分析高通量测序数据都非常关注核酸的GC含量。GC含量对于核酸稳定性来说是十分重要的因素,GC含量越高,核酸的退火温度越高,核酸相对更稳定。在高通量数据质控中,GC含量也是非常重要的因素。通过检测GC含量可以判断测序仪测序是否足够随机,是否有其他DNA污染。此外,计算核酸序列中组成基序的GC含量可以为深入了解基因组的结构和生物学功能提供很多依据。
图1. GC含量对DNA Tm的影响。
GC碱基对比AT碱基对更稳定,这是因为GC配对碱基之间有3个氢键连接(AT配对碱基之间有2个氢键连接)。有研究表明,RNA二级结构中的GC含量与原核生物适宜的生长温度之间存在很高的相关性,这可能是由中性进化和选择压力造成的。适合的GC含量有助于准确预测MicroRNA中的发夹结构,能够提高MicroRNA Agomir/ Antagomir的作用效果。
目前已经有许多方法可以确定核酸中的GC含量,其中包括熵分割、隐型马尔可夫模型(HMM)和小波收缩技术等。
安必奇生物能提供上述GC含量的计算方法,助力您准确地鉴定MicroRNA中的发夹结构,提高MicroRNA Agomir/ Antagomir的作用效果。如果您想知道更多相关的服务信息,请通过热线电话或是E-mail ()与我们联系,我们的技术人员将在24小时内回复您的所有问题及要求。
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